研究表明：新冠病毒可能于去年11月出现，变异一直在发生

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文/《财经》记者 孙爱民
编辑/王小
新冠病毒肺炎疫情已经两个多月，人们对罪魁病毒的认知还非常有限。
2月22日，南方医科大学学者通过对39条新冠病毒（SARS-CoV-2）序列进行研究，发现病毒可能出现在2019年11月左右。这一结论与学术界和官方以为的最早病例出现的时间符合：卫生部分与疾控体系普遍承认第一例病例发生于2019年12月8日，《柳叶刀》的一篇论文则以为是2019年12月1日。
对38个病毒毒株进行基因序列比力后，研究职员发现从疫情发生至今，病毒虽在变异，但厘革不大。
研究职员发现了 117处变异，变异位点没有聚集性，相对匀称地分布在整个基因组，这表明现在的突变，尚未出现特殊“激进”的变异之处。
该研究在《南方医科大学学报》网络首发，由南方医科大学公共卫生学院生物安全防护三级（P3）实行室副主任张宝传授领衔的科研团队完成。
环球多支研究团队，正在试图攻克新冠病毒。来自浙江、北京、湖北武汉等的多个P3实行室，正进行活体病毒的相干研究。
尽管病毒的基因组在疫情发生后很快被分析，基因组特性正被一层层揭晓，但这些特性还难以解释病毒为何具有强传播力。而病毒出现的时间，以及是否有中央宿主、感染源是什么、流行症是否会一直存在，也都是谜。这些题目，同样是解开新冠病毒强传播力的钥匙暗码。
“说真话，我们仍旧不知道病毒来自哪里”
谁是第一例新冠肺炎患者，至今没有消息，有人乃至已灰心地预测，会像SARS第一例患者的追寻一样，无疾而终。
从第一例患者，可以通过流行病学调查，来倒推病毒的由来、探求感染源。以中国疾控中央为主要参加单元的论文，普遍将2019年12月8日作为此次疫情第一例患者的住院时间，这也是武汉市卫健委等官方承认的时间点。
中日友好医院副院长曹彬等，在《柳叶刀》上发表的论文，则将一例2019年12月1日住院的病例，作为疫情的第一例患者。
另一种方式，是通过对病毒基因序列的研究，通过病毒基因组的特性，来推测病毒出现的时间。张宝研究团队，应用进化时间信号分析软件TempEst，分析当前基因组数据，然后进行了tMRCA（最近共同祖先出现时间）分析。
按照上述思路，遴选最佳核苷酸替代模子参数，将其采样时间2020年1月23日作为第0天，研究者终极推算新冠病毒出现的时间为此前38.9天到119.3天，即2019年9月23日到2019年12月15日之间。“按照模子盘算，病毒出现时间为1月23日往前均匀73天，95%可信区间是38到113天。所以，2019年11月10日是均匀值。”张宝对《财经》记者分析。
“病毒开始在2019年11月份出现”，这一推算与《科学》杂志的一篇报道符合。
1月24日，北京中日友好医院副院长曹彬、武汉市金银潭医院胸外科主任医师黄朝林等人，在《柳叶刀》上在线发表的论文，对最初感染的41个病人的临床症状进行了分析和总结，发现41例患者中有27例曾接触过华南海鲜市场，并将2019年12月1日的病例作为此次疫情的最早病例。
两天后，《科学》杂志因此撰文援引美国乔治敦大学流行症学专家Daniel Lucey的说法：假如12月1日出现首个病例，也确实没有华南海鲜批发市场的袒露史，思量到匿伏期的因素，这个人很可能是在11月就感染了病毒，“这种病毒是先被带入市场，然后才被带出市场的”。
不过，曹彬在担当《科学》采访时称，“说真话，我们仍旧不知道病毒来自哪里”。
变异一直在发生，未产生全新毒株
新冠病毒发生两个多月，停止2月24日18时，仅中国便有77000多例确诊患者。公众担心病毒是否在快速变异，会不会杀伤力更强。近期的多项研究，可扫除此种担忧。
张宝的研究团队，将38株病毒基因序列进行比力研究后发现：核苷酸之间厘革差异非常小，以最早测定的序列为参考，共计有117处变异，变异位点没有聚集性，相对匀称地分布整个基因组。
香港研究者发现，从香港患者身上检测出来的毒株，与武汉患者毒株相比，只差6个核苷酸。
核苷酸是病毒的遗传物质，控制病毒的复制和决定病毒特性。整个SARS-CoV-2有3万核苷酸，现在有6个突变，只占极小的比例。
2月19日，中科院西双版纳热带植物园研究员郁文彬等学者，在中科院科技论文预发布平台ChinaXiv上发表的论文表现：研究者在对93个新冠病毒样本的基因组数据研究后发现，病毒基因组没有发生重组事件，93个基因组之间有120个核苷酸发生了突变，占序列长度的0.41%，这些突变匀称分散在10个编码区。
研究者的结论是，新冠病毒基因组尚未发生重组事件是一个好消息，也就是说不会产生全新的病毒毒株。
事实上，病毒的变异一直都在发生。新冠病毒是RNA病毒。“RNA病毒跟人的基因不一样，在复制过程中没有校准机制。”上海公共卫生临床中央一名研究职员告诉《财经》记者。
从进化角度来说，病毒的进化要对自身有利，把自己变得更“毒”，会把宿主杀光，自己也无处藏身，倒霉于繁衍。但传播速率更快，显然是SARS-CoV-2的利器。
有学者提示，在疫情两个月后，要鉴戒新冠病毒传播进程的加快。
2月18日，中国科学院院士蒲慕明与中山大门生命科学学院传授吴仲义，在《国家科学批评》撰文指出：2003年SARS疫情期间，病毒在开始的两个月早期较慢传播后，进入了中期加快阶段。研究者提示：SARS病毒进化的第一阶段恰好是两个月，此次疫情“最坏的可能性是，履历了两个月的‘慢进化’模式之后，2019-nCoV‘探索’出了进化的途径，开始蠢蠢欲动。”
新冠病毒的传播力远超SARS病毒，尽管病毒基因组很快被破译，国表里多篇论文也显现了基因组特性，但这些特性还难以解释新冠病的强传播力。
2月15日，美国国立卫生研究院 (NIH) 与德克萨斯大学奥斯汀分校Jason S.McLellan研究组进行合作，使用冷冻电镜技能分析发现，SARS-CoV-2和SARS病毒的S蛋白具有雷同的功能性宿主细胞ACE2，但前者的ACE2胞外域吸引力，比SARS病毒高出10—20倍。
这仅仅是病毒传播力强解释的一方面。整个传播环节，包罗病毒的入侵、脱壳、RNA转录合成、蛋白质翻译组装、病毒成熟、释放，都决定了传播能力。传播力强，说明病毒在人间具有很好的顺应性，大概是时间改变我们周边的环境和自身的行为了。
“1月22日后的病毒序列均来自国外”
新冠病毒是否在人群中持续进化？假如答案是否定的，病毒没有快速变异，对于抵抗疫情是个定心丸。
病毒传播力的厘革，与病毒基因组序列的厘革相干，这种厘革的跟踪，须要科学家对疫情差别阶段、差别地域的病毒序列进行比对研究。然而，这一工作的开展正受到停滞。
“停止2020年2月10日，环球共有55条新型冠状病毒基因组数据公开辟布，其中1月22日从前获取的31份测序数据险些全部来自中国。然而1月22日以后，余下的24份数据一律源于境外。”蒲慕明院士与吴仲义传授在上述批评中指出，“数据背景的断层，使我们很难在时间与地理上找到一连的规律”。
首个将新冠病毒的序列公布在virological.org网站，供环球研究者共享的，是中国疾控中央研究员、复旦大学公共卫生学院兼职传授张永振的团队。他们在北京时间1月11日上午提交了序列。virological网站是一个病毒学、流行症学公开论坛。
“尽管张永振团队提交的序列，没有样品收集日期，但他所做的贡献非常大，序列分析的非常好。”张宝说，序列提交好坏常紧张的，相当于原始数据，是分析病毒变异进化、特性等工作的底子源泉，富足多的序列对于科学研究至关紧张，“数据的质量，也好坏常关键的，好比：样品的收集的日期、病人的地点，病人与病人之间的关系，病人疾病的状态等。”
然而，据知恋人士透露，张永振地点的上海公共卫生临床中央P3实行室，在1月12日便迎来有关部分的调查，并在1月13日关停整顿。该实行室在提交了整改报告之后，未得到明确回复。“不知道是什么缘故原由，但一切都发生在基因序列公开之后的第二天。重新申请活病毒的培养等相干的研究，也无法得到审批。”一位上海公共卫生临床中央工作职员说。
“对于活病毒的培养，好比跟踪病毒变异相干的研究，须要P3实行室得到羁系部分的答应。而他们实行室由于还处于整顿期间，现在只能做一些临床检测。”上述实行室的一名合作方告诉《财经》记者。
该实行室关停的缘故原由是什么，在整顿后何时可以开展相干的试验工作？停止发稿，上海市卫健委未予回应。
17年前的SARS疫情防控，可为此次疫情控制提供参考。但条件是须要更多的病毒基因组研究、序列发布，以便科学家对比这两种病毒，了解它们进化动态的差异。
正如蒲慕明院士与吴仲义传授在批评文章中所言：“鉴于当前疫情的严峻形势，选择不公开病毒相干的数据是有悖科研道德的。”